rJava 在 RStudio/R 中“升级”到 OSX Yosemite 后出现错误
我最近从OSX Mountain Lion“升级到Yosemite，从R 3.1.3升级到3.2。升级后，当我打开R或RStudio时，我立即收到一条弹出消息，说我需要安装Java 6。此外，加载或任何依赖于rJava的软件包（例如，）导致RStudio崩溃（当我通过直接打开来尝试这样做时，R也崩溃了）。rJavaxlsxR.app
在尝试了在Stack Overflow和其他地方找到的一些修复程序（下面有更多详细信息）之后，我处于加载或任何依赖于的包不再导致R崩溃，但导致以下错误的时刻：rJavarJava
library(rJava)
Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
Reason: image not found
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’
但是，如果我从命令行调用R，然后加载或任何依赖于的包，它似乎可以工作（或者至少我没有收到任何错误消息）。rJavarJava
我已经尝试了许多不同的尝试修复，其中一些几次，并且不太记得我以什么顺序做了什么（没有意识到这将是一个泥沼，并没有真正跟踪），但这里有它的要点：
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在我的（根据这个SO答案）添加了以下内容：
.bash_profileexport JAVA_HOME=“/usr/libexec/java_home -v 1.8”
export LD_LIBRARY_PATH=$JAVA_HOME/jre/lib/server -
从命令行重新配置 java，如下所示：
sudo R CMD javareconf -n
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已检查并发现此值设置为 。我尝试将其设置为以下内容（根据此SO问题）：
options("java.home")NULLoptions（“java.home”=“/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_45.jdk/Contents/Home/jre”）
安装了最新的Java开发工具包并从源代码重新安装（不记得我在哪里找到那个）。
rJava
在尝试所有这些时的某个时候，我能够在不崩溃R的情况下加载，但相反，上面发布了错误消息。此外，当我退出RStudio时，它似乎正常关闭，但随后会弹出“RStudio意外退出”消息，表明程序在尝试关闭时崩溃。rJava
我最终决定安装适用于OS X 2014-001（Java 6）的Java，因为我似乎没有选择。现在，当我打开R或RStudio时，“此软件需要Java 6”弹出消息不再出现。但是，我仍然收到上面发布的错误消息。.onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava'
在回顾我已经看过的一些帖子时，我注意到了另一个我之前错过的SO答案，它建议使用以下命令行代码打开RStudio，为RStudio提供正确的java路径：
LD_LIBRARY_PATH=$（/usr/libexec/java_home）/jre/lib/server： open -a RStudio
这打开了一个RStudio窗口，我还能够加载依赖于它的软件包而不会出错。rJava
最后，我尝试从命令行运行R（我以前没有做过）。事实证明，在命令行上，加载或任何依赖于的包都可以工作，并且不会抛出任何错误。rJavarJava
因此，如果我使用为RStudio提供java路径的代码从命令行打开RStudio，我现在就可以开始工作了（如上所述）。但是，我想找到一种方法来解决潜在的问题，无论它是什么，以便RStudio可以以通常的Mac方式打开，而无需命令行笨拙。我还担心安装旧版本的Java可能会导致问题。rJava
有没有人对如何诊断和解决此问题有任何想法？
